رویکردی جامع در شناسایی نماتود بیمارگر حشرات Steinernema siamkayai و باکتری همزیستش، Xnoehabdus stockiae با استناد به داده های مولکولی و فنوتیپی

نوع مقاله : مقاله کامل، انگلیسی

نویسندگان

گروه علوم زیستی ، دانشگاه چاندیگراه ، موهالی ، پنچاب، هندوستان

چکیده

در این تحقیق، جدایه  LD_cuنماتود بیمارگر حشرات و باکتری همزیستش، تعیین مشخصات شدند. تجزیه و تحلیل BLASTn توالی ITS نماتد، همسانی 100٪ این نمونه با  Steinernema siamkayai  را نشان داد. هم ترازی جفت جفت توالی‌ها نشان داد که هیچگونه اختلاف نوکلئوتیدی بین ناحیه ژنی ITS این نماتود با گونه S. siamkayai  وجود ندارد. ارزیابی شجره شناسی بر اساس توالی ژن ITS نیز این یافته را تایید نمود و جدایه LD_CU و گونه  S. siamkayai در یک شاخه تک نیا قرار گرفتند و با گونه های  S. huense، S. cumgarense،   S. tami و S. minutum یک شاخه خواهری شکل دادند. آزمون‌ های بیوشیمیایی نشان داد که باکتری همزیست، گونه  Xenorhabdus stockiae می‌باشد. جدایه باکتری از لحاظ واکنش های اکسیداز، کاتالاز، احیای نیترات، او نیتروفنول-بتا- دی گالاکتوپیرانوسید (ONPG)، متیل قرمز، تریپتوفان دآمیناز، تولید ایندول، اورنیتین، لیزین، سیترات، مالونات، سولفید هیدروژن، استوئین، و فنیل آلانین دآمیناز، منفی بود. اما واکنش آن برای هیدرولیز اوره و اسکولین، تحرک و تولید اسید از تخمیر گلوکز، مثبت است. جدایه باکتری  جذب قرمز خنثی را روی MacConkey آگار نشان دادند و کلنی آن، رنگدانه ای قهوه ای را روی محیط آگار تشکیل دادند. شناسایی مولکولی با استفاده از توالی ژن 16S موید هم‌سانی 100 درصدی با X. stockiae بود در حالی که با X. innexi 90 درصد همسانی نشان داد که این حکایت از واگرایی قابل توجه این گونه باکتری از سایر گونه های Xenorhabdus  است. تجزیه و تحلیل شجره‌شناسی نشان داد که جدیه باکتری ارتباط نزدیکی با  X. stockiae VP-2016b دارد ولی از گونه  X. innexi DSM 16336T تمایز قابل توجهی دارد. هم ترازی دو به دو توالی 16S نشان داد هیچ تفاوت نوکلئوتیدی بین این جدایه باکتری و X. stockiae وجود ندارد. این مطالعه، شناسایی دقیق و جامعی از نماتود بیمارگر حشرات،  Steinernema siamkayai و همزیست باکتریایی آن، Xenorhabdus stockiae  بوده و اطلاعات ارزشمندی را به موضوع طبقه‌بندی و فیلوژنی این گروه اضافه می کند.

چکیده تصویری

رویکردی جامع در شناسایی نماتود بیمارگر حشرات Steinernema siamkayai و باکتری همزیستش، Xnoehabdus stockiae با استناد به داده های مولکولی و فنوتیپی

کلیدواژه‌ها

موضوعات


CAPTCHA Image